Illustration of the approach to human gut mcicrobiome research at NFML
Illustration of the approach to human gut mcicrobiome research at NFML

인간의 장 안에는 100조 개가 넘는 미생물 세포가 있습니다. 이 미생물 군집은 대부분 박테리아로 구성되어 있으며 호스트의 총 유전자 수보다 최대 100배 더 많은 유전자를 제공함으로써 호스트 게놈의 기능적 확장 역할을 합니다. 미생물로 코딩된 효소는 숙주의 소화 효소 풀에 접근할 수 없는 식품 성분을 대부분 분해함으로써 숙주의 신진대사에서 중요한 역할을 합니다. 이것은 차례로 호스트의 상태에 영향을 미칩니다. 이 때문에 인간의 장에서 분리된 박테리아, 세트 또는 장내 미생물의 전체 공동체에 대한 연구는 영양 및 미생물학 연구에서 특별한 초점을 받았습니다. 이것은 부분적으로 지난 수십 년 동안 DNA 시퀀싱 기술과 다양한 생물정보학적 접근 방식의 발전에 의해 주도되었습니다. NFML에서는 분리된 균주와 미생물 군집을 모두 사용하여 인간 장내 마이크로바이옴에 대한 연구를 수행합니다. 이를 위해 게놈 및 metagenomic 접근 방식을 모두 사용하고 이것은 우리 안에 거주하는 수십 억 미생물의 구조화 및 기능적 관계에 대한 중요한 통찰력을 제공합니다. 우리의 현재 초점은 알려진 프리바이오틱스와 새로운 프리바이오틱스가 인간 장내 미생물 구성과 기능에 미치는 영향을 탐구하는 것입니다. 이에 대한 연구를 진행하기 위해 최근 Pacbio의 long read 시퀀싱 시스템(Sequel iie 시스템)을 인수했습니다.


연구 결과:

  1. Proteomic analysis of Bifidobacterium longum subsp. infantis reveals the metabolic insight on consumption of prebiotics and host glycans. PLoS One 2013, 8(2):e57535.
  2. Human milk oligosaccharides: the novel modulator of intestinal microbiota. BMB Reports 2012, 45(8):433-441. 
  3. Genome analysis of Bifidobacterium bifidum PRL2010 reveals metabolic pathways for host-derived glycan foraging. Proceedings of the  National Academy of Sciences USA 2010, 107(45):19514-19519.
  4. The genome sequence of Bifidobacterium longum subsp infantis reveals adaptations for milk utilization within the infant microbiome. Proceedings of the  National Academy of Sciences USA 2008,105(48):18964-18969.